summaryrefslogtreecommitdiff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2019-08-22Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver
2019-08-20gnu: edirect: Update to 12.1.20190819....Efraim Flashner
2019-08-19gnu: r-gviz: Update to 1.28.1....Ricardo Wurmus
2019-08-16gnu: r-edger: Update to 3.26.7....Ricardo Wurmus
2019-08-13Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2019-08-09gnu: freebayes: Simplify and enable tests....Ricardo Wurmus
2019-08-09gnu: freebayes: Move bamtools to inputs....Ricardo Wurmus
2019-08-09gnu: Add freebayes....Pierre Neidhardt
2019-08-09gnu: Add vcflib....Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: r-hdf5array: Update to 1.12.2....Ricardo Wurmus
2019-08-08gnu: r-biocparallel: Update to 1.18.1....Ricardo Wurmus
2019-08-08Revert "gnu: Add vcflib."...Efraim Flashner
2019-08-08Revert "gnu: Add freebayes."...Efraim Flashner
2019-08-08gnu: Add freebayes....Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add vcflib....Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add fastahack....Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add fsom....Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add multichoose....Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add smithwaterman....Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add tabixpp....Pierre Neidhardt
2019-08-07gnu: Remove ghc-parsec, ghc-stm, ghc-text, ghc-xhtml....Robert Vollmert
2019-08-06gnu: r-msnid: Update to 1.18.1....Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-rcas: Update to 1.10.1....Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.36.4....Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-rtracklayer: Update to 1.44.2....Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.14.1....Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-biomart: Update to 2.40.3....Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-limma: Update to 3.40.6....Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-edger: Update to 3.26.6....Ricardo Wurmus
2019-08-05gnu: khmer: Make gzip timestamps writable....Brian Leung
2019-07-31gnu: prank: Update to 170427....Marius Bakke
2019-07-31Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2019-07-25gnu: Explicitly refer to 'guile-json-1' when needed....Ludovic Courtès
2019-07-22Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2019-07-22gnu: htslib: Propagate zlib....Ricardo Wurmus
2019-07-18gnu: bpp: Use the default GCC....Marius Bakke
2019-07-17Merge branch 'master' into core-updatesLudovic Courtès
2019-07-17gnu: nanopolish: Fix build with GCC 7....Marius Bakke
2019-07-15gnu: salmon: Fix build with GCC 7....Marius Bakke
2019-07-15gnu: Add python-ont-fast5-api....Ricardo Wurmus
2019-07-14gnu: Adjust uses of C{,PLUS}_INCLUDE_PATH for GCC 7....Marius Bakke
2019-07-13gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.10....Ricardo Wurmus
2019-07-12Merge branch 'master' into core-updates...Marius Bakke
2019-07-09gnu: r-biocinstaller: Remove entirely....Tobias Geerinckx-Rice
2019-07-08gnu: Remove r-biocinstaller....Tobias Geerinckx-Rice
2019-07-08gnu: r-xbioc: Update to 0.1.16-1.6ff0670....Tobias Geerinckx-Rice
2019-07-05gnu: nanopolish: Update to 0.11.1-1.6331dc4....Ricardo Wurmus
2019-07-04gnu: Remove ghc-parsec, ghc-stm, ghc-text, ghc-xhtml....Robert Vollmert
2019-07-04gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.8....Ricardo Wurmus
2019-06-29gnu: r-phangorn: Update to 2.5.5....Ricardo Wurmus