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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2019-01-12gnu: r-variantannotation: Update to 1.28.8.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-edger: Update to 3.24.3.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-biocviews: Update to 1.50.10.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-systempiper: Update to 1.16.1.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-rbgl: Update to 1.58.1.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-dexseq: Update to 1.28.1.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-deseq2: Update to 1.22.2.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-scran: Update to 1.10.2.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-seqminer: Update to 7.1.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: r-bookdown: Update to 0.9.Ricardo Wurmus
2019-01-12gnu: Move Java compression packages to new module.Ricardo Wurmus
2019-01-11gnu: jamm: Remove broken "build" phase.Ricardo Wurmus
2019-01-07gnu: mantis: Limit to x86_64-linux.Efraim Flashner
2019-01-07gnu: Add mantis.Ricardo Wurmus
2018-12-20gnu: discrover: Comment on attempt of minimal texlive-union.Pierre Neidhardt
2018-12-17gnu: gess: Don't hardcode python version.Efraim Flashner
2018-12-05gnu: mash: Use C++ 14.Christopher Baines
2018-12-04gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.5.Ricardo Wurmus
2018-11-24gnu: bless: Adjust to zlib static output.Marius Bakke
2018-11-24gnu: mosaik: Fix FTBFS from b90289dadc8ee15848ce911a2bdcd3ae8302d58c.Marius Bakke
2018-11-23gnu: pigx-scrnaseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus
2018-11-23gnu: pigx-bsseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus
2018-11-23gnu: pigx-chipseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus
2018-11-23gnu: python-loompy: Remove python-typing.Ricardo Wurmus
2018-11-20Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2018-11-19gnu: r-ensembldb: Update to 2.6.2.Roel Janssen
2018-11-19gnu: r-msnbase: Update to 2.8.1.Roel Janssen
2018-11-19gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.18.1.Roel Janssen
2018-11-15gnu: Add nanopolish.pimi
2018-11-15gnu: sambamba: Update to 0.6.8.Roel Janssen
2018-11-14gnu: bioinformatics: Return #t from all phases and snippets.Mark H Weaver
2018-11-14gnu: Add jamm.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-txdb-mmusculus-ucsc-mm10-knowngene: Update to 3.4.4.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-org-mm-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-org-dm-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-org-ce-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-org-hs-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-genomationdata: Update to 1.14.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-go-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-genomeinfodbdata: Update to 1.2.0.Ricardo Wurmus
2018-11-11gnu: r-s4vectors: Update to 0.20.1.Ricardo Wurmus
2018-11-09gnu: r-ensembldb: Update to 2.6.1.Ricardo Wurmus
2018-11-09gnu: r-biostrings: Update to 2.50.1.Ricardo Wurmus
2018-11-09gnu: r-biocviews: Update to 1.50.5.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: pplacer-scripts: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: roary: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: seek: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: sailfish: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: vsearch: Update to 2.9.1.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: sra-tools: Update to 2.9.3.Ricardo Wurmus