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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2018-01-11Merge branch 'master' into core-updatesLeo Famulari
2018-01-10gnu: seqmagick: Use 'pypi-uri'.Ben Woodcroft
2018-01-10gnu: mafft: Update to 7.313.Ben Woodcroft
2018-01-09gnu: seqmagick: Update to 0.7.0.Ben Woodcroft
2018-01-03Merge branch 'master' into core-updatesLeo Famulari
2018-01-02gnu: htslib: Mark up description.Tobias Geerinckx-Rice
2018-01-02gnu: ribotaper: Wrap executables.Ricardo Wurmus
2018-01-02gnu: python-pysam: Update to 0.13.0.Tobias Geerinckx-Rice
2018-01-02gnu: htslib: Update to 1.6.Tobias Geerinckx-Rice
2017-12-31Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updatesEfraim Flashner
2017-12-27gnu: vsearch: Update to 2.6.2.Ben Woodcroft
2017-12-24gnu, doc: Use HTTPS for cran.r-project.org home pages.Tobias Geerinckx-Rice
2017-12-22gnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.2.Roel Janssen
2017-12-21Merge branch 'master' into core-updatesLeo Famulari
2017-12-19gnu: r-biomart: Update to 2.34.1.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: r-gviz: Update to 1.22.2.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: r-gqtlstats: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.2.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: r-limma: Update to 3.34.4.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: r-edger: Update to 3.20.2.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: r-biocstyle: Update to 2.6.1.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: r-dexseq: Update to 1.24.2.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: r-vegan: Update to 2.4-5.Ricardo Wurmus
2017-12-19gnu: Remove redundant cmake libdir configure flags.Efraim Flashner
2017-12-18gnu: r-seurat: Update to 2.1.0.Ricardo Wurmus
2017-12-18gnu: r-seurat: Fix ModularityOptimizer.jar.Ricardo Wurmus
2017-12-15gnu: bedtools: Update to 2.27.1.Ben Woodcroft
2017-12-14gnu: diamond: Update to 0.9.14.Ben Woodcroft
2017-12-11gnu: Switch to using the version-major procedure.Christopher Baines
2017-12-09gnu: bedtools-2.18: Fix build.Ricardo Wurmus
2017-12-06gnu: bedtools: Update to 2.27.0.Ricardo Wurmus
2017-12-03gnu: Add kallisto.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: jellyfish: Update to 2.2.7.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-annotationhub: Update to 2.10.1.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-msnid: Update to 1.12.1.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-maldiquant: Update to 1.17.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-genomicalignments: Update to 1.14.1.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-limma: Update to 3.34.2.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-variantannotation: Update to 1.24.2.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-getopt: Update to 1.20.1.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-gseabase: Update to 1.40.1.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-dexseq: Update to 1.24.1.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-deseq2: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: r-annotate: Update to 1.56.1.Ricardo Wurmus
2017-11-30gnu: metabat: Use scons-build-system.Arun Isaac
2017-11-29gnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.1.Roel Janssen
2017-11-29gnu: Add r-copynumber.Roel Janssen
2017-11-27gnu: Add java-picard-1.113.Ricardo Wurmus
2017-11-27gnu: Add java-picard.Ricardo Wurmus
2017-11-27gnu: java-htsjdk: Update to 2.3.0.Ricardo Wurmus
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