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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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2023-01-30gnu: texlive-fancyvrb: Use over deprecated texlive-latex-fancyvrb.Efraim Flashner
2023-01-30gnu: texlive-graphics: Use over deprecated texlive-latex-graphics.Efraim Flashner
2023-01-30Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updatesEfraim Flashner
2023-01-25gnu: gdcm: Add documentation.Tor-björn Claesson
2023-01-25gnu: gdcm: Ignore 3 failing tests.Tor-björn Claesson
2023-01-25gnu: Add python-slamdunk.Ricardo Wurmus
2023-01-25gnu: Add python-phylophlan.Mădălin Ionel Patrașcu
2023-01-25gnu: Add python-hclust2.Mădălin Ionel Patrașcu
2023-01-25gnu: Add python-cmseq.Mădălin Ionel Patrașcu
2023-01-25gnu: Add python-bcbio-gff/biopython-1.73.Ricardo Wurmus
2023-01-20gnu: Add r-tsis.Navid Afkhami
2023-01-20gnu: Add r-doubletcollection.Navid Afkhami
2023-01-20gnu: Add python-vireosnp.Simon Tournier
2023-01-15gnu: gdcm: Fix recursive Git source hash.Tobias Geerinckx-Rice
2023-01-17gnu: gdcm: Update to 3.0.20.Tor-björn Claesson
2023-01-16gnu: r-cytonorm: Update to 0.0.10-1.166f9ff.Ricardo Wurmus
2023-01-13gnu: r-signac: Update to 1.9.0-1.af41427.Ricardo Wurmus
2023-01-13gnu: python-cellbender: Update source hash.Marius Bakke
2023-01-12gnu: Add cellsnp-lite.Simon Tournier
2023-01-09gnu: Add r-gg3d.Ricardo Wurmus
2023-01-08gnu: Move Java XML packages to new module.Ricardo Wurmus
2023-01-08gnu: Add gdcm.Antero Mejr
2023-01-07gnu: Use old setuptools in packages that relies on use_2to3 conversion.Marius Bakke
2023-01-06gnu: bbmap: Update to 39.01.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: bbmap: Use gexp.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: nanopolish: Drop input labels.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: nanopolish: Update to 0.14.0.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: filtlong: Use Python 3.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: filtlong: Use gexp.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: filtlong: Drop input labels.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: filtlong: Remove trailing #T from build phases.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: ngless: Use gexp.Ricardo Wurmus
2023-01-06gnu: ngless: Remove trailing #T from build phases.Ricardo Wurmus
2023-01-04gnu: bamtools: Build shared libraries.Ricardo Wurmus
2023-01-04gnu: Add scallop.Ricardo Wurmus
2023-01-03gnu: Add python-bcbio-gff.Ricardo Wurmus
2022-12-30gnu: Add r-domultibarheatmap.Ricardo Wurmus
2022-12-28gnu: r-giotto: Update to 1.1.2-1.3c8067c.Ricardo Wurmus
2022-12-22gnu: Add r-bedtorch.Ricardo Wurmus
2022-12-22gnu: Add r-rhtslib12.Ricardo Wurmus
2022-12-22gnu: Add wiggletools.Ricardo Wurmus
2022-12-22gnu: Add python-episcanpy.Navid Afkhami
2022-12-22gnu: Add python-bamnostic.Navid Afkhami
2022-12-21gnu: Add vembrane.Ricardo Wurmus
2022-12-21gnu: python-plastid: Update to 0.6.0.Ricardo Wurmus
2022-12-21gnu: python-pysam: Update to 0.20.0.Ricardo Wurmus
2022-12-21gnu: htslib: Update to 1.16.Ricardo Wurmus
2022-12-21gnu: pbbam: Use htslib 1.14.Ricardo Wurmus
2022-12-21gnu: Add htslib-1.14.Ricardo Wurmus
2022-12-18gnu: python-scanpy: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus
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